Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8AO60658 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8AO60658 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms