Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX16O60231 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX16O60231 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX16O60231 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX16O60231 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX16O60231 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX16O60231 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX16O60231 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms