Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNQ3O43525 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms