Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTIFO43310 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTIFO43310 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTIFO43310 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTIFO43310 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTIFO43310 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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