Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MEFVO15553 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms