Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CEP290O15078 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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CEP290O15078 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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CEP290O15078 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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CEP290O15078 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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CEP290O15078 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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CEP290O15078 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CEP290O15078 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CEP290O15078 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CEP290O15078 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CEP290O15078 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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CEP290O15078 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CEP290O15078 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CEP290O15078 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CEP290O15078 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CEP290O15078 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CEP290O15078 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CEP290O15078 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CEP290O15078 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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