Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPNA3O00505 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms