Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EIF3FO00303 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms