Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KR12 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KR12 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KR12 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KR12 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KR12 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KR12 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KR12 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KR12 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KR12 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KR12 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KR12 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms