Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms