Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms