Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf172C9J069 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf172C9J069 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms