Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HNRNPCL3B7ZW38 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms