Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF3BA8MYP8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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