Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RGPD3A6NKT7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms