Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP73A6NFT4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms