Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf170A2RU37 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms