Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PIPSLA2A3N6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIPSLA2A3N6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms