Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRGMA1A4Y4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRGMA1A4Y4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms