Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F8A0AVK6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms