Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A3GALT2U3KPV4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms