Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA3Q9Y6H8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms