Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms