Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms