Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LEMD3Q9Y2U8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms