Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms