Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT8

ZC3H4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H4Q9UPT8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC3H4Q9UPT8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H4Q9UPT8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms