Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SETD1BQ9UPS6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1BQ9UPS6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms