Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN3Q9UPQ7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms