Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF2Q9UNY4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms