Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms