Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJD2Q9UKL4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJD2Q9UKL4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms