Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPN3Q9UHW5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms