Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2IRD1Q9UHL9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms