Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNA9Q9UGM1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA9Q9UGM1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms