Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK3Q9UBP4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK3Q9UBP4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms