Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms