Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRP2BPQ9P2M1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms