Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL9Q9P2J3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms