Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CWC25Q9NXE8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms