Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNAJC28Q9NX36 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DNAJC28Q9NX36 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms