Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3EQ9NVU0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms