Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJB4Q9NTQ9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB4Q9NTQ9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms