Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNPLA3Q9NST1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PNPLA3Q9NST1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms