Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRP7BPQ9NSQ0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms