Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms