Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TM7SF3Q9NS93 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms