Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FBXO8Q9NRD0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms