Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRDM7Q9NQW5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms