Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA4BQ9NPR2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms